nucleotide_archive_mcp
An MCP server for searching and accessing RNA sequencing datasets from the European Nucleotide Archive (ENA), supporting bulk, single-cell, and spatial transcriptomics with advanced filtering and download capabilities.
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安装
uvx nucleotide-archive-mcp
把上面的配置写入 MCP 客户端的配置文件（Claude Desktop 为 claude_desktop_config.json），重启客户端后生效。
{
"mcpServers": {
"nucleotide-archive-mcp": {
"command": "uvx",
"args": [
"nucleotide-archive-mcp"
],
"env": {
"LOG_LEVEL": "<LOG_LEVEL>",
"ENA_MAX_RPS": "<ENA_MAX_RPS>",
"ENA_TIMEOUT": "<ENA_TIMEOUT>",
"ENA_SEARCH_LIMIT": "<ENA_SEARCH_LIMIT>",
"ENA_PORTAL_API_BASE": "<ENA_PORTAL_API_BASE>",
"ENA_BROWSER_API_BASE": "<ENA_BROWSER_API_BASE>"
}
}
}
}把上面的配置写入 MCP 客户端的配置文件（Claude Desktop 为 claude_desktop_config.json），重启客户端后生效。
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